Авторизуйтесь на сервер по ssh с учётной записью root.
wget http://software.virtualmin.com/gpl/scripts/install.sh
chmod +x install.sh
Установка может производиться в нескольких вариантах: LAMP, LEMP, minimal.
./install.sh --force --bundle LAMP
Произведёт установку комплекта: